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【新闻】中国科学家率先完成枣树全基因组测序椭叶龙胆

发布时间:2020-10-18 18:58:16 阅读: 来源:泳裤厂家

中国科学家率先完成枣树全基因组测序

河北农业大学教授刘孟军带领其枣研究团队,通过与深圳华大基因科技有限公司等多家单位密切合作,在世界上率先完成了枣树的全基因组测序。

枣树原产于中国黄河中下游地区,是中国最古老的树种之一。据化石和出土文物考证,枣树在中国存在已超过1000万年。中国枣树的栽培面积和产量均占到世界的99%,且枣树已被引种到亚洲、非洲、美洲、欧洲和大洋州的40多个国家和地区。

基因组测序是打开生物学奥秘的金钥匙,同时也是一项非常复杂的系统工程。2010年,河北农业大学刘孟军教授带领其枣研究团队,在20多年枣树科研积淀基础上,开始了枣树全基因组测序。

“在本项目启动前,有关枣基因组测序的基础工作还非常薄弱,甚至连枣的基因组是多大都不知道。”刘孟军告诉,“枣的基因组属于高度复杂的类型,它的杂合度是当时利用第二代测序技术植物中最高的,而且其重复序列比例偏高,gc含量偏低,使得其测序和组装难度增大。”

刘孟军说,“我们在第二代测序技术基础上,采取了pcr-free和bac-to-bac等多种技术措施和方法,有效地克服了高度复杂枣基因组的测序、组装以及填图补洞等一道道难题,最终我们顺利完成了我国著名枣品种'冬枣’的全基因组从头测序,并且获得了高质量的枣基因组序列。

该研究项目共组装出438m的序列,占预估枣基因组大小的98%。同时把80%的序列锚定到了枣的12条假染色体上,注释出枣基因32000多个。这些基因的获得为枣后续的功能基因组学研究提供了大量的基因资源,为揭示枣特殊生物学性状的分子机制奠定了基础。

刘孟军表示,枣全基因组测序的完成,标志着中国在枣树组学研究方面达到了国际领先水平,一举跨入了世界果树基因组学研究的俱乐部。该成果对推动世界枣功能基因组学研究、促进枣树及其他果树的遗传改良和分子育种等将产生重大而深远的影响,具有重要的学术价值和潜在经济价值。

编辑:程梦

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